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病毒来自科研机构泄漏?石正丽:用生命担保与实验室无关
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2020-02-03 01:27 来源:侨报网综合 编辑:羽尧

侨报网综合讯】北京时间2月2日下午,中国科学院武汉病毒所研究员石正丽在朋友圈说:“2019新型冠状病毒是大自然给人类不文明生活习惯的惩罚,我石正丽用我的生命担保,和实验室没有关系。”此前,网上不断有流言把此次疫情的发生与中国科研机构的实验室病毒标本泄漏关联在一起。

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石正丽。(图片来源:中国科学院武汉病毒所官网)

中国科学报社旗下科学网官网微信公众号报道,2月2日,印度研究人员于1月31日发表在bioRxiv上的有关新型冠状病毒来源于实验室的论文撤稿。

1月31日,《科学》也发布最新调查报道称,生物信息学家正努力用科学击败“阴谋论”。

作为石正丽的长期合作伙伴,美国非盈利组织环保生态健康联盟疾病生态学家Peter Daszak在接受《科学》采访时表示,每当新疾病、新病毒出现时,都会产生诸如实验室泄漏或者生物工程制造一类的“阴谋论”。“这令人羞耻!”

中山大学医学院院长郭德银也对《中国科学报》表示:“阴谋论从来不需要提供证据,但科学需要。”目前,基于基因组序列对病毒在进化上的分析结果,为证明病毒来源于自然界提供了强有力的证据,足以击破人工合成的流言。

印度学者的论文说了什么?

微信公众号“小柯生命”梳理了印度学者论文的内容。(“小柯”是一个科学新闻写作机器人,由中国科学报社联合北大团队研发而成。)

1月31日,印度理工学院9名研究人员在预印本网站bioRxiv发表论文,声称在2019-nCoV突刺蛋白中发现了4个插入物与艾滋病病毒-1 gp120和Gag高度相似。

论文主要内容(注意:预印本网站bioRxiv的所有论文未经同行评议):

在2019- nCoV突刺蛋白中发现了4个插入物,它们是2019-nCoV独有的,在其他冠状病毒中不存在。

重要的是,所有4个插入物中的氨基酸残基都与艾滋病病毒HIV-1 gp120或HIV-1 Gag中的氨基酸残基相同或相似。

而且,尽管插入物在主要氨基酸序列上不连续,但2019-nCoV的3D建模表明,它们会聚构成受体结合位点。

论文作者认为,在2019-nCoV中发现4个独特的插入物,都与HIV-1关键结构蛋白中的氨基酸残基具有同一性/相似性,在本质上不太可能是偶然的。

这篇论文遭到学术界强烈质疑,论文作者被认为“夸大和扭曲了事实”。

有研究人员重新进行了原始序列比对,发现其中两个被认为与HIV中gp120一致的序列在大量其他物种中也有发现吻合度达到100%的相同序列。而另外两个被认为与HIV中gp120/Gag完全一致的序列则是通过人为加入许多氨基酸后的结果。

面对各方质疑,论文第一作者Prashant Pradhan在论文评论页面声明撤回论文,并表示课题组没有制造阴谋论的意图,感谢各方批评,将对论文进行修改。

病毒一次性进入人体,然后进行人际传播

那么,新型冠状病毒到底是从哪里来的?

中国科学报社旗下科学网官网微信公众号报道,1月11日,由复旦大学上海公共卫生临床中心暨公共卫生学院张永振教授领导的团队在virologic.org网站发布了第一个新型冠状病毒基因序列。第二天,另外5个来自不同患者的病毒基因组序列由中国国家卫健委领导的小组在全球共享流感病毒数据库GISAID发布。

随后,全球科研人员陆续公开分享更多患者的病毒基因组全序列,目前已有53例患者的病毒基因组全序列被共享在GISAID。

中国一位病毒学专家告诉《中国科学报》:“这些病毒序列应用现代测序技术,从患者血清中就可以提取。”

研究人员正在对这些病毒基因序列进行深入研究,试图了解新型冠状病毒的起源,以及它与在蝙蝠等其他动物中发现的病毒的进化关系。

华盛顿大学生物信息学专家Trevor Bedford告诉《科学》:“从病毒序列中得到的最重要的信息之一,是病毒一次性进入人体,然后进行人际传播。”

对此,前述中国病毒学家解释:“这意味着,目前正在传播中的病毒来源于同一个‘祖先’,传播路径可能是病毒从动物偶然传染给某一个特定的人,发生了变异,然后开始人际传播。所以,如果能找到最早发生感染的‘零号病人’,病毒源头就找到了。”

据《科学》报道,一个可能的解释是,近期有一批动物被感染,通过感染某一个商贩把病毒带到人类身上。

从蝙蝠到人之间还存在1个或多个中间宿主

基因组序列显示,此次流行的新型冠状病毒nCoV-2019共有2.9万多个核苷酸碱基。研究人员将它与已知冠状病毒家族其他成员进行了比较,发现其与蝙蝠来源的冠状病毒关系最密切。

1月23日,中国科学院武汉病毒所研究员石正丽带领的团队在bioRxiv发表文章指出,与此前在云南中菊头蝠上检测到的蝙蝠冠状病毒RaTG13相比较,nCoV-2019在整个基因组中与其有96.2%的一致性,与非典(SARS)冠状病毒有79.5%的一致性。

不过,Bedford分析,石正丽团队提出的RaTG13序列与nCoV-2019有近1100个核苷酸的差异。他结合其他冠状病毒的假定突变率估计,这两种病毒在25到65年前有一个共同的祖先,RaTG13病毒突变为nCoV-2019可能需要几十年的时间。

专家们的共识是,1100个核苷酸的差异意味着,nCoV-2019从蝙蝠到人之间还存在1个或多个中间宿主。

例如,非典病毒起源虽然起源于蝙蝠,但果子狸冠状病毒与人类非典病毒之间的差异只有10个核苷酸左右。所以,这就可以推断,果子狸是非典病毒的中间宿主。

“进化树”分析带来另一个好消息是,目前为止分析的不同nCoV-2019序列之间最多只有7个核苷酸的差异。这不仅表明它是最近才一次性进入人类体内的,更表明它尚未发生明显的变异。

不过,在其传播过程中,科研人员仍然没有掌握武汉华南海鲜市场发挥的作用,只能确定其在早期疫情中“推波助澜”。

“对于nCoV-2019从自然界中的某种宿主到中间宿主再到人,科学虽然难以以一种重现的方式去证明,却可以用确凿的证据,以完备的逻辑形成证据链,去确证结果。”郭德银最后强调。(完)

编辑:羽尧
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